Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CCBE1Q6UXH8 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms