Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC9A4Q6AI14 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC9A4Q6AI14 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC9A4Q6AI14 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC9A4Q6AI14 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC9A4Q6AI14 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC9A4Q6AI14 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC9A4Q6AI14 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC9A4Q6AI14 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC9A4Q6AI14 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC9A4Q6AI14 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC9A4Q6AI14 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC9A4Q6AI14 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC9A4Q6AI14 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC9A4Q6AI14 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC9A4Q6AI14 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC9A4Q6AI14 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC9A4Q6AI14 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms