Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUD6

FAM69B, Protein FAM69B, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM69BQ5VUD6 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM69BQ5VUD6 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms