Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT98

PRAMEF20, PRAME family member 20, humanhuman

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Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20Q5VT98 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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PRAMEF20Q5VT98 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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PRAMEF20Q5VT98 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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PRAMEF20Q5VT98 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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PRAMEF20Q5VT98 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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PRAMEF20Q5VT98 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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PRAMEF20Q5VT98 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRAMEF20Q5VT98 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRAMEF20Q5VT98 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRAMEF20Q5VT98 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRAMEF20Q5VT98 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRAMEF20Q5VT98 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRAMEF20Q5VT98 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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