Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms