Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPB7

AP5B1, AP-5 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5B1Q2VPB7 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP5B1Q2VPB7 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms