Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms