Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms