Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPE65Q16518 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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RPE65Q16518 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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RPE65Q16518 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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