Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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CNGA3Q16281 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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CNGA3Q16281 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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CNGA3Q16281 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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CNGA3Q16281 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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CNGA3Q16281 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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CNGA3Q16281 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CNGA3Q16281 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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CNGA3Q16281 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
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CNGA3Q16281 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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