Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.1 ms