Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms