Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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SYCP1Q15431 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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