Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

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Length 451 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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IRF4Q15306 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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IRF4Q15306 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
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IRF4Q15306 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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IRF4Q15306 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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IRF4Q15306 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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IRF4Q15306 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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IRF4Q15306 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
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