Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRKQ15262 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRKQ15262 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms