Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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NCF4Q15080 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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