Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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