Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.3 ms