Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SCARF1Q14162 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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