Protein–RNA interactions for Protein: Q13753

LAMC2, Laminin subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC2Q13753 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LAMC2Q13753 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LAMC2Q13753 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LAMC2Q13753 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LAMC2Q13753 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LAMC2Q13753 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LAMC2Q13753 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LAMC2Q13753 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LAMC2Q13753 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LAMC2Q13753 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LAMC2Q13753 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LAMC2Q13753 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LAMC2Q13753 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LAMC2Q13753 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LAMC2Q13753 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LAMC2Q13753 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LAMC2Q13753 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LAMC2Q13753 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LAMC2Q13753 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LAMC2Q13753 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LAMC2Q13753 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LAMC2Q13753 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LAMC2Q13753 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LAMC2Q13753 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LAMC2Q13753 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LAMC2Q13753 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LAMC2Q13753 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LAMC2Q13753 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LAMC2Q13753 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LAMC2Q13753 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LAMC2Q13753 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LAMC2Q13753 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LAMC2Q13753 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LAMC2Q13753 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAMC2Q13753 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAMC2Q13753 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAMC2Q13753 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAMC2Q13753 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAMC2Q13753 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAMC2Q13753 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAMC2Q13753 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAMC2Q13753 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAMC2Q13753 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAMC2Q13753 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAMC2Q13753 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAMC2Q13753 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAMC2Q13753 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAMC2Q13753 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAMC2Q13753 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAMC2Q13753 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAMC2Q13753 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAMC2Q13753 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
LAMC2Q13753 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAMC2Q13753 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAMC2Q13753 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAMC2Q13753 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAMC2Q13753 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAMC2Q13753 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAMC2Q13753 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
LAMC2Q13753 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAMC2Q13753 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAMC2Q13753 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAMC2Q13753 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAMC2Q13753 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAMC2Q13753 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAMC2Q13753 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAMC2Q13753 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAMC2Q13753 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAMC2Q13753 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAMC2Q13753 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAMC2Q13753 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAMC2Q13753 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAMC2Q13753 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAMC2Q13753 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAMC2Q13753 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAMC2Q13753 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAMC2Q13753 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAMC2Q13753 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
LAMC2Q13753 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAMC2Q13753 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
LAMC2Q13753 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAMC2Q13753 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAMC2Q13753 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAMC2Q13753 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
LAMC2Q13753 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAMC2Q13753 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAMC2Q13753 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
LAMC2Q13753 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAMC2Q13753 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAMC2Q13753 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAMC2Q13753 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAMC2Q13753 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
LAMC2Q13753 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAMC2Q13753 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LAMC2Q13753 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LAMC2Q13753 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LAMC2Q13753 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LAMC2Q13753 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LAMC2Q13753 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LAMC2Q13753 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
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