Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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