Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
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