Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
IRF5Q13568 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
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