Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEUROD1Q13562 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
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