Protein–RNA interactions for Protein: Q13522

PPP1R1A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1A, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R1AQ13522 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms