Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

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Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
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