Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN3Q13286 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms