Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

Predictions only

Length 1,914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RLFQ13129 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RLFQ13129 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RLFQ13129 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RLFQ13129 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RLFQ13129 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RLFQ13129 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RLFQ13129 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RLFQ13129 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RLFQ13129 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RLFQ13129 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RLFQ13129 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RLFQ13129 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RLFQ13129 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RLFQ13129 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RLFQ13129 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RLFQ13129 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RLFQ13129 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RLFQ13129 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RLFQ13129 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RLFQ13129 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RLFQ13129 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RLFQ13129 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RLFQ13129 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RLFQ13129 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RLFQ13129 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RLFQ13129 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RLFQ13129 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RLFQ13129 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RLFQ13129 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RLFQ13129 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RLFQ13129 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RLFQ13129 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RLFQ13129 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RLFQ13129 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RLFQ13129 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RLFQ13129 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RLFQ13129 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RLFQ13129 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RLFQ13129 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RLFQ13129 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RLFQ13129 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RLFQ13129 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RLFQ13129 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RLFQ13129 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RLFQ13129 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RLFQ13129 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RLFQ13129 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RLFQ13129 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RLFQ13129 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RLFQ13129 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RLFQ13129 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RLFQ13129 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RLFQ13129 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RLFQ13129 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RLFQ13129 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RLFQ13129 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RLFQ13129 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RLFQ13129 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RLFQ13129 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RLFQ13129 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RLFQ13129 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RLFQ13129 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RLFQ13129 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RLFQ13129 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RLFQ13129 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RLFQ13129 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RLFQ13129 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RLFQ13129 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RLFQ13129 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RLFQ13129 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RLFQ13129 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RLFQ13129 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RLFQ13129 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RLFQ13129 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RLFQ13129 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RLFQ13129 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RLFQ13129 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RLFQ13129 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RLFQ13129 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RLFQ13129 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RLFQ13129 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RLFQ13129 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RLFQ13129 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RLFQ13129 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RLFQ13129 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RLFQ13129 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RLFQ13129 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RLFQ13129 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RLFQ13129 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RLFQ13129 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RLFQ13129 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RLFQ13129 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RLFQ13129 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RLFQ13129 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RLFQ13129 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RLFQ13129 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RLFQ13129 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RLFQ13129 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RLFQ13129 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms