Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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