Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms