Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC21.29■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC21.29■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC21.29■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC21.29■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC21.29■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC21.28■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC21.28■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC21.28■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC21.27■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC21.27■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
EXOSC9Q06265 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms