Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DEUP1Q05D60 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms