Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms