Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NUCB1Q02818 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms