Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CRB1P82279 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CRB1P82279 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CRB1P82279 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CRB1P82279 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CRB1P82279 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CRB1P82279 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CRB1P82279 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CRB1P82279 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CRB1P82279 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CRB1P82279 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CRB1P82279 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CRB1P82279 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CRB1P82279 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CRB1P82279 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CRB1P82279 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CRB1P82279 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CRB1P82279 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CRB1P82279 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CRB1P82279 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CRB1P82279 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CRB1P82279 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CRB1P82279 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CRB1P82279 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CRB1P82279 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRB1P82279 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRB1P82279 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRB1P82279 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRB1P82279 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRB1P82279 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRB1P82279 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRB1P82279 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRB1P82279 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRB1P82279 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRB1P82279 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRB1P82279 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRB1P82279 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRB1P82279 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRB1P82279 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRB1P82279 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRB1P82279 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRB1P82279 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CRB1P82279 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRB1P82279 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRB1P82279 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRB1P82279 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRB1P82279 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRB1P82279 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CRB1P82279 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CRB1P82279 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CRB1P82279 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CRB1P82279 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CRB1P82279 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRB1P82279 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRB1P82279 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRB1P82279 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRB1P82279 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRB1P82279 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRB1P82279 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRB1P82279 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRB1P82279 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRB1P82279 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRB1P82279 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRB1P82279 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRB1P82279 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRB1P82279 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRB1P82279 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRB1P82279 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRB1P82279 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRB1P82279 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRB1P82279 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRB1P82279 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRB1P82279 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRB1P82279 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRB1P82279 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRB1P82279 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRB1P82279 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRB1P82279 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CRB1P82279 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRB1P82279 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRB1P82279 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CRB1P82279 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CRB1P82279 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRB1P82279 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRB1P82279 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CRB1P82279 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRB1P82279 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRB1P82279 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRB1P82279 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CRB1P82279 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRB1P82279 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRB1P82279 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRB1P82279 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRB1P82279 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRB1P82279 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRB1P82279 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRB1P82279 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRB1P82279 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRB1P82279 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRB1P82279 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms