Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SKP1P63208 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SKP1P63208 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SKP1P63208 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKP1P63208 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKP1P63208 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKP1P63208 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKP1P63208 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKP1P63208 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKP1P63208 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKP1P63208 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKP1P63208 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKP1P63208 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKP1P63208 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKP1P63208 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKP1P63208 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKP1P63208 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKP1P63208 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKP1P63208 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKP1P63208 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKP1P63208 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKP1P63208 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKP1P63208 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKP1P63208 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKP1P63208 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKP1P63208 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKP1P63208 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKP1P63208 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SKP1P63208 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKP1P63208 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKP1P63208 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKP1P63208 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SKP1P63208 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKP1P63208 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKP1P63208 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKP1P63208 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKP1P63208 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKP1P63208 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKP1P63208 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKP1P63208 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKP1P63208 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKP1P63208 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKP1P63208 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKP1P63208 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKP1P63208 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKP1P63208 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SKP1P63208 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKP1P63208 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKP1P63208 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKP1P63208 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKP1P63208 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKP1P63208 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SKP1P63208 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKP1P63208 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKP1P63208 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKP1P63208 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKP1P63208 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKP1P63208 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKP1P63208 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKP1P63208 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKP1P63208 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKP1P63208 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKP1P63208 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKP1P63208 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKP1P63208 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKP1P63208 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKP1P63208 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKP1P63208 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SKP1P63208 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKP1P63208 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKP1P63208 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKP1P63208 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKP1P63208 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SKP1P63208 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKP1P63208 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKP1P63208 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKP1P63208 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SKP1P63208 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKP1P63208 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKP1P63208 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SKP1P63208 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SKP1P63208 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKP1P63208 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKP1P63208 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SKP1P63208 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKP1P63208 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKP1P63208 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKP1P63208 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKP1P63208 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKP1P63208 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKP1P63208 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKP1P63208 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKP1P63208 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKP1P63208 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKP1P63208 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKP1P63208 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKP1P63208 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKP1P63208 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKP1P63208 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKP1P63208 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms