Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 CSPG4P11-201ENST00000560634 4910 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 NRP2-204ENST00000360409 6662 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 OR52A1-202ENST00000380367 9783 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms