Protein–RNA interactions for Protein: P61204

ARF3, ADP-ribosylation factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3P61204 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ARF3P61204 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARF3P61204 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARF3P61204 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARF3P61204 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARF3P61204 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARF3P61204 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARF3P61204 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARF3P61204 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ARF3P61204 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARF3P61204 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARF3P61204 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARF3P61204 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARF3P61204 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARF3P61204 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARF3P61204 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARF3P61204 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARF3P61204 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARF3P61204 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARF3P61204 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARF3P61204 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARF3P61204 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ARF3P61204 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARF3P61204 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARF3P61204 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARF3P61204 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARF3P61204 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARF3P61204 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARF3P61204 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARF3P61204 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ARF3P61204 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARF3P61204 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARF3P61204 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARF3P61204 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARF3P61204 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARF3P61204 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARF3P61204 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARF3P61204 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ARF3P61204 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARF3P61204 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARF3P61204 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ARF3P61204 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARF3P61204 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARF3P61204 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARF3P61204 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARF3P61204 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARF3P61204 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARF3P61204 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARF3P61204 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARF3P61204 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARF3P61204 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARF3P61204 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARF3P61204 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARF3P61204 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARF3P61204 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARF3P61204 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARF3P61204 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARF3P61204 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARF3P61204 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARF3P61204 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARF3P61204 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARF3P61204 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARF3P61204 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARF3P61204 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARF3P61204 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARF3P61204 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARF3P61204 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARF3P61204 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARF3P61204 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARF3P61204 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARF3P61204 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARF3P61204 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARF3P61204 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARF3P61204 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARF3P61204 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARF3P61204 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARF3P61204 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ARF3P61204 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARF3P61204 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARF3P61204 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARF3P61204 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ARF3P61204 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARF3P61204 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARF3P61204 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARF3P61204 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARF3P61204 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARF3P61204 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ARF3P61204 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARF3P61204 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARF3P61204 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARF3P61204 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ARF3P61204 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARF3P61204 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARF3P61204 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARF3P61204 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ARF3P61204 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARF3P61204 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARF3P61204 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARF3P61204 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARF3P61204 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms