Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP9P55211 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP9P55211 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP9P55211 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP9P55211 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP9P55211 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP9P55211 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP9P55211 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP9P55211 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP9P55211 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP9P55211 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP9P55211 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP9P55211 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP9P55211 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP9P55211 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP9P55211 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP9P55211 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP9P55211 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP9P55211 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP9P55211 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP9P55211 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP9P55211 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP9P55211 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP9P55211 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP9P55211 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP9P55211 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP9P55211 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP9P55211 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP9P55211 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP9P55211 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP9P55211 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP9P55211 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP9P55211 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP9P55211 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP9P55211 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP9P55211 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP9P55211 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP9P55211 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP9P55211 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP9P55211 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP9P55211 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP9P55211 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP9P55211 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP9P55211 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP9P55211 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP9P55211 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP9P55211 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP9P55211 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP9P55211 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP9P55211 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP9P55211 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP9P55211 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP9P55211 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP9P55211 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP9P55211 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP9P55211 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP9P55211 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP9P55211 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP9P55211 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP9P55211 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP9P55211 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP9P55211 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP9P55211 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP9P55211 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP9P55211 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP9P55211 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP9P55211 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP9P55211 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP9P55211 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP9P55211 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP9P55211 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP9P55211 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP9P55211 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP9P55211 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP9P55211 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP9P55211 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP9P55211 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP9P55211 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP9P55211 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP9P55211 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP9P55211 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP9P55211 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP9P55211 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP9P55211 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP9P55211 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP9P55211 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP9P55211 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP9P55211 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP9P55211 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP9P55211 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP9P55211 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP9P55211 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP9P55211 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP9P55211 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP9P55211 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP9P55211 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP9P55211 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP9P55211 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP9P55211 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP9P55211 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms