Protein–RNA interactions for Protein: P55087

AQP4, Aquaporin-4, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AQP4P55087 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AQP4P55087 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AQP4P55087 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AQP4P55087 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AQP4P55087 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AQP4P55087 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AQP4P55087 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AQP4P55087 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AQP4P55087 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AQP4P55087 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AQP4P55087 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
AQP4P55087 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AQP4P55087 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AQP4P55087 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AQP4P55087 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AQP4P55087 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AQP4P55087 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
AQP4P55087 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AQP4P55087 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AQP4P55087 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AQP4P55087 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AQP4P55087 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AQP4P55087 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AQP4P55087 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
AQP4P55087 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AQP4P55087 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AQP4P55087 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AQP4P55087 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AQP4P55087 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AQP4P55087 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AQP4P55087 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
AQP4P55087 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AQP4P55087 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AQP4P55087 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AQP4P55087 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AQP4P55087 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
AQP4P55087 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AQP4P55087 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AQP4P55087 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
AQP4P55087 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AQP4P55087 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AQP4P55087 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
AQP4P55087 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AQP4P55087 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AQP4P55087 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
AQP4P55087 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AQP4P55087 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
AQP4P55087 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
AQP4P55087 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AQP4P55087 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AQP4P55087 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
AQP4P55087 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
AQP4P55087 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
AQP4P55087 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
AQP4P55087 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
AQP4P55087 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AQP4P55087 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AQP4P55087 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AQP4P55087 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AQP4P55087 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AQP4P55087 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AQP4P55087 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AQP4P55087 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AQP4P55087 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AQP4P55087 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AQP4P55087 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
AQP4P55087 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AQP4P55087 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
AQP4P55087 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AQP4P55087 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AQP4P55087 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AQP4P55087 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AQP4P55087 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AQP4P55087 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AQP4P55087 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AQP4P55087 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AQP4P55087 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AQP4P55087 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AQP4P55087 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
AQP4P55087 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
AQP4P55087 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AQP4P55087 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AQP4P55087 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AQP4P55087 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AQP4P55087 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AQP4P55087 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AQP4P55087 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AQP4P55087 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AQP4P55087 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
AQP4P55087 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AQP4P55087 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AQP4P55087 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AQP4P55087 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AQP4P55087 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AQP4P55087 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AQP4P55087 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AQP4P55087 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AQP4P55087 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AQP4P55087 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AQP4P55087 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms