Protein–RNA interactions for Protein: P55058

PLTP, Phospholipid transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLTPP55058 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLTPP55058 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLTPP55058 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLTPP55058 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLTPP55058 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLTPP55058 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLTPP55058 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLTPP55058 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLTPP55058 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLTPP55058 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLTPP55058 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLTPP55058 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLTPP55058 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLTPP55058 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLTPP55058 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PLTPP55058 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLTPP55058 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLTPP55058 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLTPP55058 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLTPP55058 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLTPP55058 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLTPP55058 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLTPP55058 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLTPP55058 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PLTPP55058 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLTPP55058 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLTPP55058 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLTPP55058 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLTPP55058 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLTPP55058 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLTPP55058 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PLTPP55058 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLTPP55058 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PLTPP55058 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLTPP55058 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLTPP55058 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLTPP55058 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLTPP55058 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLTPP55058 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLTPP55058 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLTPP55058 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLTPP55058 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PLTPP55058 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLTPP55058 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLTPP55058 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLTPP55058 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLTPP55058 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLTPP55058 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PLTPP55058 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PLTPP55058 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLTPP55058 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLTPP55058 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLTPP55058 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLTPP55058 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLTPP55058 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLTPP55058 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLTPP55058 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLTPP55058 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLTPP55058 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLTPP55058 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLTPP55058 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLTPP55058 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLTPP55058 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLTPP55058 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLTPP55058 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLTPP55058 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLTPP55058 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLTPP55058 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLTPP55058 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PLTPP55058 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLTPP55058 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLTPP55058 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLTPP55058 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLTPP55058 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLTPP55058 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLTPP55058 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLTPP55058 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLTPP55058 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLTPP55058 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLTPP55058 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLTPP55058 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLTPP55058 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLTPP55058 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLTPP55058 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLTPP55058 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLTPP55058 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLTPP55058 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLTPP55058 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLTPP55058 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLTPP55058 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLTPP55058 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLTPP55058 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLTPP55058 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLTPP55058 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLTPP55058 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLTPP55058 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLTPP55058 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLTPP55058 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLTPP55058 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLTPP55058 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms