Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTPAP49638 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTPAP49638 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTPAP49638 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTPAP49638 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTPAP49638 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTPAP49638 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTPAP49638 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TTPAP49638 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTPAP49638 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTPAP49638 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTPAP49638 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTPAP49638 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTPAP49638 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTPAP49638 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTPAP49638 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTPAP49638 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TTPAP49638 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTPAP49638 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTPAP49638 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTPAP49638 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTPAP49638 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTPAP49638 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTPAP49638 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTPAP49638 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTPAP49638 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTPAP49638 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTPAP49638 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTPAP49638 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTPAP49638 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTPAP49638 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTPAP49638 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTPAP49638 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTPAP49638 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTPAP49638 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTPAP49638 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTPAP49638 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTPAP49638 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTPAP49638 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTPAP49638 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTPAP49638 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTPAP49638 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTPAP49638 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTPAP49638 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTPAP49638 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTPAP49638 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTPAP49638 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTPAP49638 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTPAP49638 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTPAP49638 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTPAP49638 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTPAP49638 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTPAP49638 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTPAP49638 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTPAP49638 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTPAP49638 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TTPAP49638 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTPAP49638 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTPAP49638 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTPAP49638 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTPAP49638 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTPAP49638 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTPAP49638 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTPAP49638 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTPAP49638 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTPAP49638 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTPAP49638 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTPAP49638 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTPAP49638 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTPAP49638 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTPAP49638 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTPAP49638 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTPAP49638 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTPAP49638 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTPAP49638 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTPAP49638 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTPAP49638 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTPAP49638 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TTPAP49638 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTPAP49638 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTPAP49638 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTPAP49638 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTPAP49638 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TTPAP49638 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TTPAP49638 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTPAP49638 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTPAP49638 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTPAP49638 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTPAP49638 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTPAP49638 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTPAP49638 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTPAP49638 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTPAP49638 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTPAP49638 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTPAP49638 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTPAP49638 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTPAP49638 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTPAP49638 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTPAP49638 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TTPAP49638 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
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