Protein–RNA interactions for Protein: P48169

GABRA4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA4P48169 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms