Protein–RNA interactions for Protein: P47756

CAPZB, F-actin-capping protein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZBP47756 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPZBP47756 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms