Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACADSBP45954 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms