Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms