Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CTNNB1P35222 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms