Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXC13P31276 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms