Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
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