Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

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Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRGP23470 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
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